Uno de los diseñadores en jefe de Nintendo, Katsuya Euguchi, ha confirmado que los discos especiales que utilizará el Wii U tendrán la misma capacidad que un Blu-ray de una capa, unos 25 GB.

También existen rumores sobre que la capacidad flash interna del Wii U será de 8 GB. Lo que sí está confirmado es que la consola tendrá compatibilidad con con discos duros externos USB para añadirle más espacio de almacenamiento.